kolmapäev, märts 21, 2007

Statistikat

Ettevaatust, matemaatika! Nõrganärvilistele järgnevat kirjatükki ei soovita. Eelkommentaarina nii palju, et algselt kirja panduna oli teine mitu korda pikem ja manitsevam :)

Täna oli teine päev kolmeosalisest statistikakursusest, ja teemaks hüpoteeside testimine. Mulle kogu see '5% olulisusnivoo juures aktsepteerime nullhüpoteesi' kraam ei istu, ei ole nagu intuitiivne. Bioloogidele sobib ta paremini, ja ma ei hakanud virisema ka.

Tore juudi taat väitis, et hüpoteesi vastu võtmiseks või ümber lükkamiseks arvutatakse andmete tõenäosus antud hüpoteesi kehtivuse korral p(data | H), aga intuitiivselt tuleks seda mõista kui hüpoteesi tõenäosust p(H | data).

Siis ta tõi sellise näite: oled kaua peo peal, jääd magama pikaks pikaks ajaks, ärkad üles, väljas sajab lund. Nii, püstitad hüpoteesi, et on talv. Näite mõte oli, et p(lumi | talv) on väike (Cambridge's, kus lund sajab kord aastas), aga p(talv | lumi) on suur (sest kui sajab, sajab talvel).

Inglismaal sajab lund kord-paar aastas: p(lumi | talv) ~ 0.02. Seega traditsioonilise 5% usaldusnivoo juures peaks me hüpoteesi 'talv' ümber lükkama! Samamoodi ka kevade ja suve ja sügise. Selle koha peal hakkas taat puterdama, kõigil tekkis hämming, ja paari minuti pärast kuulutati lõuna.

Tegelikult on ju palju loomulikum kirjeldada kõigepealt kõikvõimalikud hüpoteesid, ja nende algsed tõenäosused, ja leida nende tõenäosus peale andmete nägemist. Ise ka ei oleks osanud paremat näidet välja mõelda, et miks statistilised testid ikkagi ebaintuitiivsed on. Kasutage Bayesi meetodeid, kui võimalik.

Disclaimer: klassikalistel statistilistel testidel on oma aeg ja koht ka olemas, aga see koht pole nii suur, kui eelmise sajandi kirjanduse järgi võiks arvata.

teisipäev, märts 20, 2007

Natukene ussidest


Niisiis. Kuna tegu ikkagi ka kohaga, kus ma peaksin muuhulgas ka oma õpingute käekäiku salvestama, siis nüüd paari sõnaga oma praegusest projektist, mis kestab maikuuni.

Järgmised 6 nädalat mängin ma vihmaussidega. Doktoriprogrammis on kirjas, et kõik teevad kolm rotatsiooniprojekti, vähemalt ühe laboris, ja vähemalt ühe arvutis. Kaks arvutit on tehtud, nüüd olengi pipettide ja mikroskoobi juures.

Laboris olen ma ainult petteks - rühmajuhil on tegelikult tarvis hoopis protokolli, mille abil kõige paremini vihmausside muutusi tuvastada ja arvudesse panna. Selleks on väga abiks piltide pealt vihmaussid kokku lugeda, üle mõõta, ja ära kirjeldada. Ehk siis mina istun ikka suure osa arvutis ja katsun sellistelt piltidelt ussiinfot kätte saada, ja vahepeal käin laboris usse kasvatamas ja teen teinekord suuremaid avastusi nagu et ümara põhjaga anumatesse lähevad ussid kõik ühte kohta kokku ja pilt on keerulisem kui lameda põhjaga anumates.

Tegelikult on laboris täitsa tore. Saab pipettidega mängida ja mikroskoopide ja tsentrifuugide ja kemikaalidega. Näiteks 70% etanooli on siin lademetes, aga ei ole nagu N.Liidu ajal - ka hommikul on kõik veel alles. Bakterid haisevad vastikult ja kui pimedasse mikroskoobiruumi vaadata, siis hakatakse karjuma, aga muidu võib päris ära harjuda.

teisipäev, märts 06, 2007

Ajakirjandus

Väljavõte kohalikust lehest. Kui enda aias enam tööd teha ei ole, saad *täiesti tasuta* teiste inimeste puid maha võtta.

---------------------
Free wood available.

Cherry tree needs to be cut up (16 inch diameter).

First come first served.

Located in front garden of ....